Вход для сотрудников

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение
«ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР ПИЩЕВЫХ СИСТЕМ
ИМ. В.М.ГОРБАТОВА»
Российской Академии Наук

УДК 577.112:543.545:57.085:636.4
Ил. 2. Библ. 14.

DOI: 10.21323/2071-2499-2019-1-54-57

Применение протеомных технологий для изучения тимуса, селезенки и мезентеральных лимфатических узлов свиней

Ахремко А.Г., Федулова Л.В., канд. техн. наук, Василевская Е.Р.
ФНЦ пищевых систем им. В.М. Горбатова
Ключевые слова: двумерный электрофорез, протеомика, тимус, селезенка, лимфатические узлы, иммунопротеом,
Реферат:
Данная работа посвящена изучению протеома иммунных органов свиньи – тимуса, селезенки, мезентеральных лимфатических узлов. Получены типичные двумерные электрофореграммы данных органов, обнаружены 600 фракций в селезенке, 547 фракций в тимусе и 613 фракций в мезентеральных лимфатических узлах, в том числе органоспецифичные белки (362, 219 и 155 фракций соответственно). Анализ полученных электрофореграмм с помощью информационных ресурсов позволил выявить активные соединения, обладающие различными функциями, преимущественно иммунорегуляторными. Полученные результаты являются перспективой для создания иммунопротеомных карт с целью разработки иммуномодулирующих средств на их основе.


Proteomic technologies in pigs’ thymus, spleen and mesenteric lymph nodes study

Akhremko A.G., Fedulova L.V., Vasilevskaya E.R.
Gorbatov Research Center for Food Systems
Key words: proteomic, thymus, spleen, lymph nodes, immunoproteome, two-dimensional electrophoresis
Summary:
This article is devoted to pig’s immune organs proteome study – thymus, spleen, mesenteric lymph nodes. Typical two-dimensional electrophoregrams of these organs were obtained, 600 fractions were found in spleen, 547 fractions in thymus and 613 fractions in mesenteric lymph nodes, including organ-specific proteins (362, 219 and 155 fractions, respectively). Bioinformatics analysis revealed active compounds with various functions, mainly immunoregulatory. The results are a prospect for creating immunoproteome maps.


СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ / REFERENCES:

1. Петренко, Е.С. В поиске специфических маркеров глиобластомы: анализ протеоформ глиобластомных клеток / Е.С. Петренко, А.Т. Копылов, О.А. Клейс, О.К. Легина, Н.В. Белякова, Р.А. Пантина, С.Н. Нарыжный // Цитология. – 2018. – Т. 60. – № 7. – С. 519–523.

Petrenko, E.S. V poiske spetsificheskikh markerov glioblastomy: analiz proteoform glioblastomnykh kleto [In search of specific markers of glioblastoma: analysis of proteoforms of glioblastoma cells] / Е.S. Petrenko, A.T. Kopylov, O.A. Kleis, O.K. Legin, N.V. Belyakova, R.A. Pantina, S.N. Naryzhny // Cytology. – 2018. – T. 60. – № 7. – P. 519–523.

2. База данных «Протеомика мышечных органов». Электронный ресурс. – Режим доступа: [http://mp.inbi.ras.ru] (дата обращения: 18.01.2019).

Baza dannykh «Proteomika myshechnykh organov» [Database «Proteomics of the muscular organs»]. Elektronnyy resurs [Electronic resource]. URL: [http://mp.inbi.ras.ru] (data obrashcheniya: 18.01.2019).

3. База данных «UniProt Protein Database». Электронный ресурс. – Режим доступа: [https://www.uniprot.org/] (дата обращения: 18.01.2019).

Baza dannykh «UniProt Protein Database» Elektronnyy resurs [Electronic resource]. URL: [https://www.uniprot.org/] (data obrashcheniya: 18.01.2019).

4. База данных «Swiss-prot» Электронный ресурс. – Режим доступа: [https://www.uniprot.org/uniprot/?query=reviewed:yes] (дата обращения: 18.01.2019).

Baza dannykh «Swiss-prot» Elektronnyy resurs [Electronic resource]. URL: [https://www.uniprot.org/uniprot/?query=reviewed:yes] (data obrashcheniya: 18.01.2019).

5. База данных «PepBank» Электронный ресурс. – Режим доступа: [http://pepbank.mgh.harvard.edu/] (дата обращения: 18.01.2019).

Baza dannykh «PepBank» Elektronnyy resurs [Electronic resource]. URL: [http://pepbank.mgh.harvard.edu/] (data obrashcheniya: 18.01.2019).

6. Чернуха, И.М. Сравнительное изучение автолитических изменений протеома мышечной ткани свинины и говядины / И.М. Чернуха, А.Г. Ахремко // Теория и практика переработки мяса. – 2018. – Т. 3. – № 3. – С. 56–63.

Chernukha, I.M. Sravnitel’noye izucheniye avtoliticheskikh izmeneniy proteoma myshechnoy tkani svininy i govyadiny [A comparative study of autolytic changes in the proteome of pork and beef muscle tissue] / I.M. Chernukha, A.G. Akhremko // Theory and practice of meat processing. – 2018. – T. 3. – № 3. – P. 56–63.

7. Василевская, Е.Р. Методология исследования белково-пептидных компонентов экстрактов тканей sus scrofa / Е.Р Василевская, Е.А. Котенкова, Е.А. Лукинова, Е.А Калинова // Теория и практика переработки мяса. – 2017. – Т. 2. – № 3. – С. 79–85.

Vasilevskaya, E.R. Metodologiya issledovaniya belkovo-peptidnykh komponentov ekstraktov tkaney sus scrofa [Methodology for the study of protein-peptide components of sus scrofa tissue extracts] / E.R. Vasilevskaya, E.A. Kotenkova, E.A. Lukinova, E.A Kalinova // Theory and practice of meat processing. – 2017. – T. 2. – № 3. – P. 79–85.

8. Kimura, Y. Construction of quantitative proteome reference maps of mouse spleen and lymph node based on two-dimensional gel electrophoresis / Y. Kimura, R. Yokoyama, Y. Ishizu, T. Nishigaki, Y. Murahashi, A. Hijikata, H. Kitamura, O. Ohara // Proteomics. – 2006. – Т. 6. – № 13. – P. 3833–3844.

9. Zhang, X. An RNA helicase, RHIV–1, induced by porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is mapped on porcine chromosome 10q13 / X. Zhang, C. Wang, L.B. Schook, R.J. Hawken, M.S. Rutherford // Microbial pathogenesis. – 2000. – Т. 28. – № 5. – P. 267–278.

10. Sriperumbudur, R. Transforming growth factor-β (TGFβ) and its signaling components in peri-ovulatory pig follicles / R. Sriperumbudur, L. Zorrilla, J.E. Gadsby // Animal reproduction science. – 2010. – Т. 120. – № 1–4. – P. 84–94.

11. Agah, A. Isolation, characterization, and cloning of porcine complement component C7 / A. Agah, M.C. Montalto, C.L. Kiesecker, M. Morrissey, M. Grover, K.L. Whoolery, R.P. Rother, G.L. Stahl // The Journal of Immunology. – 2000. – Т. 165. – №. 2. – P. 1059–1065.

12. Ruiz-Cortés, Z.T. Porcine leptin receptor: molecular structure and expression in the ovary / Z.T. Ruiz-Cortés, T. Men, M.F. Palin, B.R. Downey, D.A. Lacroix, B.D. Murphy // Molecular Reproduction and Development: Incorporating Gamete Research. – 2000. – Т. 56. – № 4. – P. 465–474.

13. Chen, X. Molecular cloning, tissue expression and protein structure prediction of the porcine 3-hydroxy–3-methylglutaryl-coenzyme A reductase (HMGR) gene / X. Chen, X. Wang, Z. Li, L. Kong, G. Liu, J. Fu, A. Wang // Gene. – 2012. – Т. 495. – № 2. – P. 170–177.

14. Wang, H. Characterization of porcine EPLIN gene revealed distinct expression patterns for the two isoforms / H. Wang, H. Wang, Z. Zhu, S. Yang, S. Feng, K. Li // Animal biotechnology. – 2007. – Т. 18. – № 2. – P. 101–108.


Контакты:

Ахремко Анастасия Геннадьевна
ahremko94@gmail.com
Федулова Лилия Вячеславовна
l.fedulova@fncps.ru
Василевская Екатерина Романовна
e.vasilevskaya@fncps.ru

Для цитирования:

Ахремко, А.Г. Применение протеомных технологий для изучения тимуса, селезенки и мезентеральных лимфатических узлов свиней / А.Г. Ахремко, Л.В. Федулова, Е.Р. Василевская // Все о мясе. – 2019. – № 1. – С. 54-57.

For citation:

Akhremko, A.G. Proteomic technologies in pigs’ thymus, spleen and mesenteric lymph nodes study / A.G. Akhremko, L.V. Fedulova, E.R. Vasilevskaya // Vsyo o myase. – 2019. – № 1. – Р. 54-57.





Политика конфиденциальности

Противодействие коррупции

Карта сайта

Яндекс цитирования Яндекс.Метрика